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1.宏病毒組技術(shù)與宏基因組技術(shù)和擴(kuò)增子技術(shù)的共同點(diǎn)及區(qū)別?
宏病毒組技術(shù)與宏基因組技術(shù)和擴(kuò)增子技術(shù)都是從樣品中的總DNA出發(fā)進(jìn)行研究的,避免了對(duì)微生物進(jìn)行分離純化和培養(yǎng),提供了對(duì)樣品中的全部微生物進(jìn)行研究的新技術(shù)。在擴(kuò)增子技術(shù)中,其主要對(duì)微生物DNA上的某一段區(qū)域,如16S V3/V4/V3-V4等進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序和分析;在宏基因組技術(shù)中,則會(huì)使用樣品中的所有微生物基因組DNA進(jìn)行研究,并完成后續(xù)一系列數(shù)據(jù)處理和挖掘;而在宏病毒組技術(shù)中,其主要以環(huán)境中所有病毒的遺傳物質(zhì)為研究對(duì)象,分析樣品中的病毒構(gòu)成信息。
2.宏病毒組的研究應(yīng)用
宏病毒組學(xué)可以全面解讀樣品中病毒的多樣性和豐度,探索病毒之間以及與環(huán)境及宿主之間的關(guān)系。由于宏病毒組學(xué)的研究對(duì)象是特定環(huán)境中病毒的總DNA+cDNA,因而不需要對(duì)微生物進(jìn)行分離培養(yǎng)和純化,且可以對(duì)樣品中的DNA病毒和RNA病毒進(jìn)行研究,這對(duì)我們研究樣品中的總病毒提供了一條新的途徑。
在短短的幾年里,人們用這種方法發(fā)現(xiàn)了很多有意義的病毒,并擴(kuò)大了很多病毒的宿主范圍,增強(qiáng)了人們對(duì)環(huán)境中包括各種媒介生物的病毒組成的了解,研究領(lǐng)域涉及到人類腸道、動(dòng)物組織、血液、水體等,充分顯示出宏病毒組技術(shù)在病毒發(fā)現(xiàn)、病原溯源、微生物預(yù)警等方面的應(yīng)用價(jià)值。
3.宏病毒組樣本要求
樣品類型
樣品質(zhì)量要求
寄送要求
DNA樣品(RNA病毒需要反轉(zhuǎn)錄為雙鏈DNA)
樣本起始量(單次):≥ 1μg/樣品
短時(shí)間(24h內(nèi))保存或運(yùn)輸可以使用冰袋;長(zhǎng)時(shí)間(72h內(nèi))運(yùn)輸建議采用干冰加冰袋的方式。樣本保存期間切忌反復(fù)凍融。
樣本濃度: ≥ 20 ng/uL
樣本純度:OD260/280為1.8-2.0并確保DNA 無(wú)降解
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